La obra de San Pelayo tuvo su orígen en el año 2006, cuando el pastor de la congregación de Cereté, comisionó a los obreros Pedro López e Indira Espitia, líderes a su cargo, para iniciar un grupo de oración ubicado al lado del comando de la Policía en el barrio el centro de San Pelayo.

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Aunque el inicio fue un tiempo de muchos retos debido a la arraigada tradición religiosa de la población, el respaldo del Espíritu Santo se hacía cada vez más evidente, porque Dios iba trabajando en los corazones de los escogidos y el mensaje de salvación iba penetrando en el alma de los fieles. Con el paso del tiempo, el grupo de oración fue creciendo en todas las áreas, hasta que llegó el momento de organizarse como congregación.

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En consecuencia, y después de formalizar los trámites correspondientes, la congregación de San Pelayo se inauguró oficialmente el 6 de noviembre de 2006. Tiempo en el cual, los pastores  encargados de la obra, continuaron con el trabajo de evangelización, expansión y consolidación, enfrentando grandes desafíos como el tiempo de la pandemia, prueba de la que salieron airosos, gracias al respaldo y cuidado de Dios por su obra. 

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San Pelayo es un municipio del departamento de Córdoba  ubicado en la subregión del Sinú Medio, fundada el 6 de mayo de 1777 por Antonio De La Torre y Miranda; en el año 1923 ascendió a municipio del departamento de Bolívar, hasta que, en 1951  mediante la ley que creó el departamento de Córdoba pasó a esta nueva jurisdicción. San Pelayo es conocido principalmente por ser la sede del Festival Nacional del Porro, un ritmo musical tradicional colombiano. Su economía se deriva principalmente de la ganadería, agricultura y pesca. Además, la extracción de arena del río Sinú es una actividad económica importante para algunas personas que viven cerca de sus orillas. Asimismo, el turismo, asociado a su expresión musical y cultural genera ingresos para la localidad.